怕这件事太牵扯自己的思绪,影响到给人看病时的专心度,清早起来,林明不仅修习了八段锦和导引功,还特地又修习了一下制感,清除了由此事带来的一些杂念。
这样,在诊所接诊患者中,他的心态一直平稳平静,接诊质量稳定。
江浩、迈克尔和周选等几个斯坦福学生今天陆续来复诊过。
经过林明再次治疗,病情各有不同程度好转,修习运气五脏操的,也各有进展。
经过林明纠正,江浩已从肺操进展到腹操,甲亢的燥热感减轻了三分。
林明让他先巩固修习成果,不忙向心操、肝操进展。
迈克尔对运气五脏操也终于有了进展,不管理解成氧气还是什么气,反正他可以简单做肺操了,对缓解他的神经性头痛已经小有帮助。
周选已经能做简单的肺操,对他的病情缓解目前还看不到什么帮助,但他相信林明,决定坚持修习下去。
复诊中,林明和周选这个生物信息学博士聊了聊他的专业,发现周选的课题刚好是做代谢组学数据分析,一下子兴趣大增!
他们的实验课题要发高分论文,最缺这样一个人才!
机制实验后期,他们要做代谢组学深度挖掘、多组学关联分析、分子对接模拟——这些全是生物信息学的活儿!
他们课题组目前没人做得了这个活儿,外包太贵,临时雇人不现实,而周选的人品,以及他目前的研究课题真的很适配他们课题组!
就不知道周选到时能不能顾得上给他们帮帮忙了。
林明把这事记在心里,暂时也没跟周选说,准备等周选病情大为好转,他们之间也更熟络些再跟周选谈。
一个上午的接诊工作平静,从容而繁忙。
期间林明接了凯瑞保险补充和替代医学部门高级经理托马斯·里德的一个电话,告知他给凯瑞保险递的加急通道申请已经通过了,他重新成为了凯瑞保险网络的一个服务提供商了!
这件事让林明兴奋了一下。
这意味着他的医疗人群范围又可以拓展一下了。
然后林明还接到威尔逊的一个电话,通知他参芪清感复方二期临床实验已经通过了伦理委员会的审查,目前进入了合同审查阶段,最迟四个周出审查结果。
接到这个电话,林明打电话告诉了姬连勇一声。
姬连勇小激动了一下:“谢谢林医生!我爸回国后还几次给我打电话询问这件事,我都没好意思问你这件事,现在总算进入最后的合同审查了,谢谢,谢谢!”
“不用谢,这件事我会一直盯着的,有什么问题我再和你联系。”林明道。
同时他心里也感叹在斯坦福办事之难,一个二期临床实验项目就需要这审批那审批,每一项审批都拖这么长时间!
而且,后面进入二期临床实验的话,他又得经常跑斯坦福医院感染科了,这会让他的时间绷得更紧!
想想就有些头疼。
但要想在前程上迎风奋进,不忙碌是不可能的,只能是想办法尽量协调安排各方面的事情和时间线了。
周二上午就这样过去了。
中午时,柯丝婷给林明发了一张她养的猫咪图片,林明夸了一下好看,然后柯丝婷询问了一下林明他们课题实验的进展,林明回答正在等待送检结果出来。
浅聊辄止。
卡特琳娜在WhatsApp上和林明聊了一下对一些病的中医和现代医学的不同治疗法,之后不可避免地又聊到送检结果,卡特琳娜感觉群体感应通路方向可能性更大,林明说但愿吧。
也是浅聊辄止,卡特琳娜只能在忙碌的工作中抽时间和他聊几句。
然后是中诊科技小群的聊天,林明和许清、陈远、马修都冒了冒泡,互相了解了一下彼此的工作进度,许清鼓励他们加油,资本温情小富婆的形象正在深入林明三人心中。
下午三点多,林明终于收到了送检结果邮件!
林明迅速打开邮件翻看代谢组学的数据报告。
群体感应通路的下调信号很明确!
ROS也有变化,但信号远没有群体感应通路强!
这就已经确定了,他们接下来的机制实验方向,肯定是选群体感应通路了!
这条路,应该比ROS通路实验难度小点儿!
林明立即把这份送检结果在课题小组小群中通报了,这下集体兴奋了,在群里一阵讨论!
连后来加入小群,但一直处于潜水状态的陈清源教授也被“炸”了出来,提议原定周三晚上的课题小组会议改成今晚七点半!
而且他提议,他们小组以后的实验时间是否可以改成七点半到九点半,这样大家晚上也不用熬到十一点了。
林明感觉这个提议很好,以前是因为和陈教授自己的课题实验时间顶撞,所以他们的课题实验才排到九点到十一点,现在陈教授的课题实验中止了,暂时还没有新的课题实验,这就不存在大问题了。
“我没意见,大家看呢?”林明问道。
卡特琳娜和蒂莫西都很快表态没问题。
刘伟道:“我也没问题,只是需要老板重新排班一下。”
他打工的那家中餐馆常常开到午夜,把他的班往后排排就是了。
这样,这件事就定了下来。
晚上七点半,课题小组所有成员在实验室聚齐,包括共同PI陈教授也来了,“确定机制实验方案”会议准时开始。
林明调出代谢组学数据报告投到屏幕上。
一张张代谢物差异峰图、富集分析气泡图在投影幕上铺开,暖白色的实验室光线下,每个人的瞳孔里都映着一小片跳动的荧光。
“从送检样本的代谢组学分析来看,最显著的信号集中在群体感应通路。”
林明用笔尖点着大屏上的KEGG通路富集分析气泡图。
“C12-HSL和C4-HSL——铜绿假单胞菌的两类核心AHL信号分子——在联合用药组中分别下调了五到六倍。”
“几个下游受控基因的表达产物也明显减少,绿脓菌素下调最明显,弹性蛋白酶和碱性蛋白酶也跟着降。”
“这说明药物不是直接杀菌——联合用药组的细菌载量变化不大——而是在干扰细菌的通讯系统。细菌收不到同伴的信号,即使数量够多,也不会同步启动耐药。”
顿一顿,林明放大另一副图。
“氧化应激通路也有信号,ROS水平上升约两倍,抗氧化酶表达小幅上调,但没有出现细胞膜脂质过氧化或DNA氧化损伤的典型标志。更像是代谢扰动带来的继发效应,不是主通路。”
所有人都仔细看着图表。
陈清源翻了几页数据表,目光扫过一个个数据峰值,然后缓缓开口。
“嗯,群体感应信号强度是ROS的十倍。C4-HSL和C12-HSL同时下调,说明药物作用于AHL合成或感知的上游靶点,而不是针对单一信号分子——这正好解释为什么复方比单药效果好。下游毒力因子也同步下调,说明不是偶然波动。”
“还有更重要的一点——氧化应激信号集中在用药前三天,第四天开始回落。群体感应抑制的信号从第三天持续到第十五天,和药效曲线完全吻合。”
“看来,ROS是烟花,放完就没了。群体感应是钟,一直在走。”
陈清源说着,目光微微转动。
“如果真是群体感应干扰是主通路——”
他用记号笔在屏幕旁边的白板上画出一条时间线来。
“大样本实验的数据是到第十五天的,从第七天开始四组差距拉开,第十天差距达到最大值,第十五天仍然维持,但没有进一步扩大——这说明联合用药的效应从第十天开始趋于饱和。”
“所以,我们应该在第三天到第七天之间检测到AHL合成酶的活性变化,第十天左右达到最大抑制,然后进入平台期。”
他在时间线上标了几个数字。
“所以,机制实验的关键时间窗是前三到十天。检测指标锁定两个核心靶点——LasI和RhlI合成酶的mRNA表达量和酶活性,再加一个下游毒力因子绿脓菌素作为效应验证。”
林明几人听了思索一阵,都相继点头,这就算把接下来的机制实验的大方向确定下来。
接下来是继续修正和完善机制实验预案,制定成真正的机制实验方案,以及实验分工问题。
制定和完善方案用了一个半小时,分工倒是简单了些。
陈清源:负责关键节点的数据审核和方案把关,不参与平时具体操作。
林明:负责统筹+数据分析+后续组织病理。给药方案(提取物浓度1:8、联合抗生素的比例、给药时间点)由他根据预案细化,明天下午发到群里。
卡特琳娜:负责AHL合成酶活性检测。这个需要跟平台约机器(她已经约了周三),另外她还要把LasI/RhlI的引物序列、退火温度表整理好给蒂莫西,抑制剂和阳性对照也由她准备。
蒂莫西:负责RT-qPCR检测LasI/RhlI mRNA表达量。时间窗是第三到十天,需要在这段时间内取三到四个时间点的样本提取RNA。
刘伟:负责大蜡螟模型的给药、取样、表型观测和绿脓菌素定量。蒂莫西取完RNA剩下的样本交给他做绿脓菌素测定。
会议结束时,已经到了十点多,今天讨论量大,超出原定的九点半。
不过,大家都毫无怨言,反而都绷起了一股更大的劲儿来,接下来,整个预实验就进入最关键的时期了!
整个预实验能否成功,在此一搏!
下楼离开时,这次林明是跟大家一起坐电梯下去的。
陈教授拍着林明肩膀笑道:“林明,你们要真把这个实验课题做成了,发个不错的论文,不仅对争取下一步临床实验有帮助,说不定还能争取到新的资助,那样,大家跟着你也有奔头!”
“但愿吧,”林明笑着点点头,“谢谢陈教授的指导和鼓励!”
此时他的脑海中正有系统世界线浮现出金色文字来:
【检测到宿主科研线正在继续推进】
【任务:率领团队完成群体感应通路验证】
【A方案:两周内完成,数据偏差值≤1.5%。奖励:论文撰写技能·入门→大成】
【B方案:两周内完成,数据偏差值≤3%。奖励:论文撰写技能·入门→小成】
林明再次选择了B方案,A方案的精度要求过高,他还是要稳扎稳打来。
但这时系统出现了一段提示:
【检测到宿主核心行为模式冲突】
【宿主多次选择次优方案,主动放弃最优奖励路径】
【宿主有实质性脱离“追求卓越“的底层驱动模型】
【建议宿主进行修正,否则将削弱本系统存在价值】
林明心里咯噔了一下,这可不是系统第一次提醒他了,以前就这样提醒过他两次,他有些不太明确会发生什么。
但想了想,他还是选择了B方案,这个论文撰写技能对他来说太重要了,选择A方案几乎必定会泡汤!
“下次吧,下次我一定选择A方案,哪怕明知拿不到奖励也要选择A方案!”
林明心里道。
一边的,他看了刘伟一眼,这小子一直满含希望地看着他。
林明知道刘伟心中的渴望。
这小子的OPT时间有限,目前回国也难以找到合适工作,所以,如果能靠参与这个课题延长他留在这边的时间,慢慢打出一个学术新身份来,那么将来无论是留在这边,还是回国,都要比现在回国强出太多。
所以,刘伟太希望他林明能带着他们把这个课题搞成功了!
“为了他们,我也一定要把这个实验课题搞成功!”林明心里默默道。
第140章:一位稀有患者
加州三月里平均六天会有一场中小雨,这一段时间稠密了些。
周三又是一场小雨天。
不过,林家诊所依然患者不断,有日常口碑发酵的原因,有林明撬开了斯坦福大学医疗需求一角的原因,也有网红大卫宣传的原因。